Helixio, prestataire de services RNA-seq
Le séquençage de l’ARN (RNA-seq) permet d'analyser l'expression des gènes et d'explorer la complexité du transcriptome. Il répond à de nombreuses applications, telles que la quantification de l'expression génique, l'identification de gènes différentiellement exprimés, l'analyse de l'épissage alternatif, la détection de variants, la découverte de nouveaux transcrits et isoformes, l'assemblage de novo du transcriptome, ainsi que l'étude des ARN non codants et des petits ARN.
Nous proposons différents protocoles adaptés à la nature de vos échantillons et aux objectifs de votre étude, qui permettent notamment l’utilisation d’échantillons en faible quantité (ultra low input) et dégradés. Nous vous accompagnons dans le choix de la solution la plus adaptée à votre projet.
- Total RNA-Seq
Explorez l'ensemble du transcriptome codant et non codant
Le total RNA-Seq permet une analyse globale des ARN exprimés, incluant les ARN messagers, les ARN longs non codants et de nombreuses autres classes d'ARN. Cette approche est particulièrement adaptée aux études de régulation transcriptionnelle et à la découverte de nouveaux transcrits.
- mRNA-Seq
Quantifiez l'expression génique et révélez les mécanismes de régulation
Le mRNA-Seq cible les ARN messagers polyadénylés afin de fournir un profil d'expression précis des gènes codants. Il constitue la méthode de référence pour les études de transcriptomique comparative, l'identification de gènes différentiellement exprimés et l'analyse des voies biologiques.
- Dual RNA-Seq
Décryptez les interactions hôte-pathogène
L’approche dual RNA-seq permet d’étudier l’expression des gènes de deux organismes en interaction, en analysant les transcrits, codants et non codants, de l’hôte et de partenaire associé.
Cette technologie permet de décrypter les mécanismes moléculaires impliqués dans différentes relations interspécifiques telles que l’infection, le parasitisme, la symbiose ou la compétition. Applicable à de nombreux modèles impliquant des pathogènes bactériens, fongiques ou protozoaires chez des hôtes animaux ou végétaux, elle offre l’avantage d’analyser plusieurs espèces à partir d’une seule librairie de séquençage, sans séparation préalable. Le Dual RNA-seq permet ainsi d’identifier les réponses de l’hôte (sensibilité, résistance, immunité) ainsi que les stratégies d’adaptation du pathogène au cours de l’interaction.
- Small RNA-Seq
Capturez les petits ARN impliqués dans la régulation de l'expression génique
Le small RNA-Seq permet la caractérisation des microARN (miRNA), piRNA, siRNA et autres petits ARN à partir d'échantillons solides, liquides ou de vésicules extracellulaires (EV). Elle est particulièrement utilisée dans les études d'épigénétique, de recherche de biomarqueurs et de communication cellulaire.
Pour l’analyse de données, comme l’alignement sur le génome/transcriptome de référence, quantification des gènes et des transcrits, analyses différentielles et fonctionnelles, visitez notre page bioinformatique !