Helixio, prestataire de services DNA-seq
Le séquençage de l’ADN (DNA-seq) permet de lire et d’analyser l’information génétique contenue dans un échantillon. Cette approche est utilisée dans de nombreux domaines, le plus couramment afin d’identifier des variants génétiques entre individus ou entre échantillons. Selon les objectifs de l’étude, différentes stratégies peuvent être mises en place.
La profondeur de séquençage est ajustée en fonction des objectifs du projet, de l’organisme étudié et des exigences spécifiques de l’analyse.
Nous proposons différents protocoles adaptés à la nature de vos échantillons et aux objectifs de votre étude, qui permettent notamment l’utilisation d’échantillons en faible quantité et faible qualité. Nous vous accompagnons dans le choix de la solution la plus adaptée à votre projet.
- Séquençage du génome entier (Whole Genome Sequencing – WGS)
Une vision complète du génome
Le séquençage du génome entier (WGS) permet le reséquençage de l'intégralité de n’importe quel génome (eucaryote et procaryote).
Il permet d'identifier un large éventail de variations génétiques ponctuelles et structurales, tels que les polymorphismes nucléotidiques (SNP), mutations, insertions et délétions (InDels), variations du nombre de copies (CNV), ainsi que les inversions et les translocations.
Pour les organismes ne disposant pas d'un génome de référence, nous proposons des stratégies d'assemblage de novo, avec annotation fonctionnelle en fonction des bases de données les plus pertinentes.
- Séquençage de l'exome entier (Whole Exome Sequencing – WES)
Une approche ciblée des régions codantes
Le séquençage de l'exome (WES) cible spécifiquement les régions codantes pour des protéines, qui concentrent une grande partie des variants connus.
Cette approche permet d'obtenir de réduire le volume de données générées. Le WES est l’approche privilégiée pour identifier les variants rares grâce à une profondeur de séquençage accrue.
Pour l’analyse de données, comme l’alignement sur le génome de référence, l’analyse de variants ou encore l’assemblage de novo, visitez notre page bioinformatique !